பயன்பாட்டு நுண்ணுயிரியல் என்பது நுண்ணுயிரிகளின் பயன்பாடு மற்றும் அவற்றைப் பற்றிய அறிவைக் கையாளும் ஒரு அறிவியல் துறையாகும். பயன்பாடுகளில் பயோடெக்னாலஜி, விவசாயம், மருத்துவம், உணவு நுண்ணுயிரியல் மற்றும் உயிரியல் திருத்தம் ஆகியவை அடங்கும்.
பயன்பாட்டு நுண்ணுயிரியல் என்பது நுண்ணுயிர் உலகம் மற்றும் அது நமது சொந்தத்துடன் தொடர்பு கொள்ளும் விதம் பற்றிய ஆய்வு ஆகும். பயோடெக்னாலஜி முதல் பூச்சி கட்டுப்பாடு, உயிர் சுத்திகரிப்பு ஆலைகள், மருந்து பயன்பாடுகள் வரையிலான பகுதிகளில் நுண்ணுயிரிகளின் சக்திகளை நாம் எவ்வாறு பயன்படுத்தலாம் மற்றும் பயன்படுத்த முடியும் என்பதை இது பார்க்கிறது.