ஜர்னல் ஆஃப் ஆட்டோகாய்ட்ஸ் எடிட்டர்களால் உன்னிப்பாகக் கண்காணிக்கப்படும் இரட்டை குருட்டு மதிப்பாய்வு செயல்முறையை ஏற்றுக்கொள்கிறது. மதிப்பாய்வு செயல்முறைக்கு அனுப்பும் முன், சமர்ப்பிப்பின் தரம் மற்றும் வகையை மதிப்பிடுவதற்கு ஆசிரியர்கள் தலையங்க மதிப்பாய்வை மேற்கொள்கின்றனர். அறிவியல் தரநிலைகளை பூர்த்தி செய்யாத கையெழுத்துப் பிரதிகள் மறுஆய்வு செயல்முறைக்கு பரிசீலிக்கப்படாது. ஆசிரியர்களுக்கான அறிவுறுத்தல்களுக்கு ஆசிரியர்கள் கவனம் செலுத்துவார்கள் என்று எதிர்பார்க்கப்படுகிறது, மேலும் அது ஆய்வுக் கட்டுரையாக இல்லாவிட்டால் அவர்கள் வெளியிடும் வகையையும் குறிப்பிடுவார்கள். எடிட்டர்கள் வாசிப்புத்திறன், இலக்கண பயன்பாடு ஆகியவற்றைச் சரிபார்ப்பார்கள், மேலும் இந்த அளவுருக்களில் பேப்பர்கள் மோசமாக இருந்தால் மீண்டும் சமர்ப்பிக்கும்படி கேட்கலாம். மதிப்பாய்வாளர்கள் வழங்கிய அனைத்து கருத்துகளையும் பரிந்துரைகளையும் கருத்தில் கொண்டு தலைமை ஆசிரியரால் இறுதி முடிவு எடுக்கப்படுகிறது. பத்திரிகையில் வெளியிடப்படும் அனைத்து கட்டுரைகளும் கடுமையான சக மதிப்பாய்வு செயல்முறைக்கு உட்பட்டவை.